پپتیدهای بازدارنده عمدتاً در تحقیقات علمی، از جمله سنجش مهار آنزیمی، توسعه مدل‌های غربالگری دارو، و مطالعه مکانیسم‌های بیماری استفاده می‌شوند.
در مقایسه با پپتیدهای مشتق شده طبیعی، پپتیدهای بازدارنده سنتز شده شیمیایی مزایایی مانند سازگاری دسته‌ای-به-دسته بالا و خلوص قابل کنترل ارائه می‌دهند. سیستم های کنترل کیفیت دقیق تضمین می کند که وزن مولکولی، توالی اسیدهای آمینه و فعالیت بازدارنده هر دسته با استانداردهای تعیین شده مطابقت دارد. این محصولات به عنوان محصولات درجه{4} درجه ممتاز طبقه بندی می شوند و تحت یک فرآیند بازرسی کیفیت سه سطحی قرار می گیرند: تجزیه و تحلیل HPLC برای خلوص، طیف سنجی جرمی برای تأیید وزن مولکولی، و آزمایش فعالیت بیولوژیکی. آنها در مقادیر کم (0.1 میلی‌گرم/0.0001 کیلوگرم) بسته‌بندی می‌شوند تا در عین حال از ضایعات مرتبط با بسته‌بندی بزرگ‌تر جلوگیری کنند. علاوه بر این، سنتز شیمیایی آنها خطر پاتوژن‌های اغلب مرتبط با معرف‌های{11}مشتق‌شده از حیوانات را از بین می‌برد و در نتیجه ایمنی آزمایشی را افزایش می‌دهد.
